Recherche
Magali
Ribot
Thèmes de recherche :
Modélisation pour la biologie,
Analyse numérique des équations aux dérivées partielles, Analyse des équations aux dérivées partielles.
Sujets de recherche récents :
- Modélisation de la formation de biofilms par des modèles hydrodynamiques.
- Modélisation pour la biologie et la médecine à l'aide d'EDPs
(traitement de biofilms, microbiote intestinale, croissance du tissu
adipeux, ...).
- Modèles hyperboliques et paraboliques pour le chimiotactisme; étude numérique et analytique.
- Modèles d'EDPs hyperboliques sur réseau; étude numérique et analytique; applications à la biologie et à l'irrigation.
- Modèles de poursuite-évasion; étude numérique et analytique.
- Schémas de type well-balanced et asymptotic preserving.
Responsabilités de projets :
- Janvier 2015 - Décembre 2017 :
Responsable français du projet PICS CNRS/CNR "Modèles mathématiques et simulations numériques pour le mouvement de cellules" (co-responsable italien : Roberto
Natalini).
- Janvier 2011 - Décembre 2014 :
Responsable du projet ANR Jeunes
Chercheurs-Jeunes Chercheuses MONUMENTALG.
- Janvier 2008 - Décembre 2009 :
Responsable français du projet CNRS/CNR "Modélisation
de la biodégradation des monuments" (co-responsable italien : Roberto
Natalini).
Participation à des projets :
-
2022 - 2023 : Membre du projet APR-IA Région MOMASYBIO "Modélisation mathématique pour les systèmes biologiques" (responsable : Cécile Carrère).
- 2021-... : Membre du projet ARD Région JUNON porté par le BRGM
(coordinatrice pour l’Institut Denis Poisson).
- 2021-... : 2021 - ... : Membre du projet ECOS Chili ”Coarsening dynamics : numerical and theoretical analysis of the Lifshitz-Slyozov equation with nucleation and applications to biology” (responsable : Romain Yvinec).
- 2021-... : 2021 - ... : Membre du projet ANR Jeunes chercheurs ”Mathematical model of Adipose TIssue DYnamics” (responsable : Chloé Audebert).
- Janvier 2016 - Décembre 2018 :
Membre du projet ANR Défi de tous les savoirs BactPhys porté par Fernando Peruani.
Encadrements de thèses :
- Octobre 2023-... : Co-encadrement avec Boris Andreianov de la thèse de Marion Meutelet, Université de Tours
- Octobre 2022-... : Co-encadrement avec Cécile Carrère de la thèse de Paguiel Hossie, Université d'Orléans
- Octobre 2020-Octobre 2023 : Co-encadrement avec Romain Yvinec de la thèse de Leo Meyer, Université d'Orléans,"Modélisation et analyse de modèles pour la distribution en taille des adipocytes"
- Janvier 2017 - Octobre 2018 : Encadrement de la thèse de Thi Ngoc Thuy Phan, Université d'Orléans
- Septembre 2013 - Septembre 2016
:
Co-encadrement avec Thierry Goudon de la thèse
de Bastien Polizzi, Université de Nice - Sophia Antipolis, "Modélisation et simulations numériques pour des systèmes de la mécanique des fluides avec contraintes; application à la biologie et au trafic routier ".
- Septembre 2009 - Février 2012
:
Co-encadrement avec Roberto Natalini de la thèse
de Monika Twarogowska, Università di L'Aquila "Numerical approximation and analysis of mathematical models
arising in cells movement".
- Septembre 2007 - Avril
2011
: Co-encadrement avec Roberto Natalini de la thèse de Cristiana di
Russo, bourse de l'Université Roma Tre, "Analysis and Numerical
Approximations of Hydrodynamical Models of Biological Movements".
Encadrements de stages de master :
- 2022 : Co-encadrement du projet de 3ème annéee d’Ecole Centrale Paris
de Mathilde Jehanno et Emma Waechter à l’Ecole Centrale Paris.
- 2021 : Co-encadrement du projet de 3ème annéee d’Ecole Centrale Paris
de Romain Ranini et Elisa Wallez à l’Ecole Centrale Paris.
- 2020 : Encadrement du stage de Master 2 de Leo Meyer à l'Université
d'Orléans.
- 2019 : Encadrement du stage de Master 1 de Leo Meyer à Sorbonne Université.
- 2019 : Encadrement du stage de Master 2 de Tran Chanh Dao Le à l'Université
d'Orléans dans le cadre du Master Franco-Vietnamien.
- 2019 : Encadrement du stage de Master 1 de Benjamin Jarriau à l'Université
d'Orléans.
- >2017 : Encadrement du stage de Master 2 de Ngoc Hoang Phuong Le à
l’Université d’Orléans dans le cadre du Master Franco-Vietnamien.
- 2017 : Encadrement du stage de Master 1 de Bilel Bousselmi à l’Université d’Orléans.
- 2016 :
Encadrement du stage de master M2 de Hoai Thuong Nguyen.
- 2015 :
Co-encadrement avec Thierry Goudon et Sebastian Minjeaud du stage de master M2 de Julie Llobell.
- Juin 2014 - Novembre 2014 : Co-encadrement des stages pré-doctoraux de Pratik Mumbar (avec Thierry Goudon, Boniface Nkonga et Bastien Polizzi) et de Tathagata Goswami (avec Thierry Goudon, Béatrice Laroche et Bastien Polizzi)
- 2013 :
Co-encadrement avec Florent Berthelin du stage de master M2 de Bastien Polizzi "Modélisation multi-voies du trafic routier".
- 2007 :
Co-encadrement avec Roberto Natalini du stage de master de Cristiana di
Russo, à l'IAC-Roma sur la modélisation, l'analyse et la simulation
d'équations mono-dimensionnelles modélisant le chimiotactisme.
Membre de jurys de thèses et d'HDR :
-
Décembre 2023 : Présidente du jury de thèse de Marie Haghebaert, INRAE-Université de Saclay
-
Décembre 2023 : Membre du jury d'HDR de Vincent Perrollaz, Université de Tours.
-
Décembre 2023 : Présidente du jury de thèse de Pedro Jaramillo, Université de Bordeaux.
-
Décembre 2023 : Membre du jury d'HDR d'Annabelle Collin, Université de Bordeaux.
-
Juillet 2023 : Rapport sur la thèse de Sébastien Tran Tien, Université Lyon 1
-
Décembre 2022 : Rapport sur la thèse de Flavien Alonzo, Université de Nantes
-
Octobre 2022 : Membre du jury de thèse de Michele Romanos, Université de Toulouse 3
-
Août 2022 : Présidente du jury de thèse de Mete Demercigil, Université Lyon 1
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Juin 2022 : Présidente du jury de thèse de Kyriaki Dariva, Université Lyon 1
-
Juin 2022 : Présidente du jury de thèse de Noémie Gaveau, Université d'Orléans
-
Février 2022 : Membre du jury de thèse de Bachar Tarraf, Université de Bordeaux.
-
Décembre 2021 : Présidente du jury de thèse de Thao Le, Université de Tours.
-
Octobre 2021 :Membre du jury de thèse de Liudi Lu, Sorbonne Université.
-
Février 2021 : Rapport sur la thèse de Elishan Braun, Univesité Roma Tre
- Décembre 2020 :Présidente du jury de thèse de Kevin Atsou, Université Nice Cote d’Azur
- Décembre 2020 : Jury d'HDR de Romain Yvinec, Université de Tours.
- Novembre 2020 :Membre du jury de thèse de Thi Nhu Thao Nguyen, Université de Besançon, Bourgogne Franche-Comté.
- Octobre 2020 :Membre du jury de thèse de Nicolas Ratto, Universit ́e Lyon 1.
- Juillet 2020 : Rapport sur la thèse de Federica Bubba, Sorbonne Université
- Juin 2020 : Rapport sur la thèse (et jury) de Vincent Quedeville, Université de Toulouse 3
- Décembre 2019 : Jury d'HDR d'Astrid Decoene, Université d'Orsay
- Septembre 2019 : Rapport sur la thèse (et jury) de Sophie Hecht, Imperial College,
Londres
- Septembre 2019 :Présidente du jury de thèse d'Andrea Bondesan, Université de
Paris
- Juillet 2019 : Présidente du jury de thèse de Martina Iapichino, Université Nice
Cote d'Azur (thèse en physique)
- Juillet 2019 : Présidente du jury d'HDR de David Sanchez, Université de Toulouse
- Décembre 2018 :Membre du jury de thèse de Fabien Wahl, Université Paris 6
- Novembre 2018 : Présidente du jury de thèse de Simon Girel, Université Lyon 1.
- Octobre 2018 : Présidente du jury de thèse de Quentin Richard, Université de Besançon, Franche-Comté
- Octobre2018: Membre du jury de thèse de Thi Minh Nhat Vo, Université d'Orléans.
- Septembre 2018 : Présidente du jury de thèse d'Arthur Marly, ENS Lyon.
- Juin 2018 : Membre du jury de thèse de Cécile Taing, Université Paris 6.
- D ecembre 2017 : Pr ésidente du jury de thèse de Rémi Tesson, Université de Marseille.
- Novembre 2017 : Présidente du jury de thèse de Manon Deville, Université de Bordeaux.
- Octobre 2017 : Rapport sur l'HDR de Philippe Thomen, Université Paris 6.
- Mars 2017 : Membre du jury de thèse d'Ayuna Barlukova, Université de Marseille
- Décembre 2016 : Présidente du jury de thèse d'Andjela Davidovic, Université de Bordeaux
- Décembre 2016 : Membre du jury d'HDR de Carine Lucas, Université d'Orléans
- Novembre 2016 : Présidente du jury de thèse de Mathilde Legrand, Université d'Orléans
- Juin 2016 : Présidente du jury de thèse de Pierre-Louis Colin, Université Lille 1.
- Mars 2016 : Rapport sur la thèse de Casimir Emako, Université Paris 6.
- Juillet 2015 : Rapport sur la thèse de Diane Peurichard, Université Toulouse 3.
- Juin 2015 : Rapport sur l'HDR de Pascal Redou, ENIB Brest.
Membre de comités de suivi
- 2022-... : Membre du comité de suivi de la thèse de Louis Fostier, INRAE Nouzilly
- 2021-2023 : Membre du comité de suivi de la thèse de Marie Haghebaert, INRAE
Jouy-en-Josas - Université de Saclay
- 2021 - ... : Membre du comité de suivi de la thèse de Simone Nati Poltri , Université
de Bordeaux.
- 2018-... : Membre du comité de suivi de la thèse de K. Aruma , Université d’Orléans.
- 2017-... : Membre du comité de suivi de la thèse de S. Corridore, Université de Bordeaux.
- 2017 - ... : Membre du comité de suivi de la thèse de D. Maldonado , Université d’Orléans.
Invitations à l'étranger :
- Professeur invitée à La Sapienza, à Rome par Gabriella Puppo en 2020 (1 mois)
- Invitation par Roberto Natalini à l’IAC-CNR Roma en 2016, 2017, 2018, 2019, 2022, 2023 (2 semaines).
- Invitation à Imperial College pour 5 mois en 2015 (CNRS-Imperial College Fellowship).
- Invitation par K. Aoki à Kyoto en 2015.
- Invitation par Maya Briani à l'IAC-CNR Roma en 2014, 2015.
- Invitation par Gabriella Puppo à l'Università degli Studi dell'Insubria à Côme en 2014, 2015.
- Invitation de l'IFCAM à Bangalore (Inde) pour un cours lors de l'école d'été "Numerics and Control of PDEs" en Juillet 2013.
- Invitation par Roberto Natalini à l'IAC-CNR Roma en 2007 (4 mois), en 2008 (2 mois) et 2010 (1 mois), puis en 2011, 2012, 2013, 2014 (1 semaine).
- Invitation par Jan S.Hesthaven au Department of Applied Mathematics, Brown University, Providence en 2004 (2 mois).
Invitations de chercheurs étrangers à l’université d’Orléans :
- 2022 : invitation de Maya Briani pour une semaine.
- 2018 : invitation de Guoxian Chen pour un an dans le cadre du programme international Le Studium de l’Université d’Orléans.
- 2017 : invitation de Gabriella Puppo comme professeur invité et de Maya Briani pour une semaine.
- 2017 : invitation de Monika Twarogowska pour une semaine.
- 2016 : invitation de Maya Briani pour une semaine.
Invitation comme oratrice lors de congrès :
- 2024 : Conférencière plénière à Bio-PDE à Vienne
- 2022 : conférence ESMTB à Heidelberg, conférence Mathematical Modeling of Organization in Living Matter au CIRM
- 2021 : cours lors du workshop ”Multi-scale modeling for pattern formation in biological systems”. au Mittag-Leffler Insitute, Suède ; cours lors du congrès ’Hispano- French School Jacques-Louis Lions on Numerical Simulation in Physics and Engineering’ à Madrid, exposé lors du congrès "modèles mathématiques pour le microbiote intestinal", Besançon
- 2020 : Conférence ”Convergent aquatic photosynthesis modelling for our planet” au domaine des Treilles
- 2019 : Journées Maths et Filles à Pau ; Master Class au CIRM à Marseille; journées numériques à Amiens; Conférencière
plénière congès Conference of the Euro-Maghreb International Research
Network in Mathematics and Applications à Madrid
- 2018 : Invitation au workshop Mathematics for Complex Microbial Systems à Toronto ; Conférencière plénière à Forum Jeunes Matéhmaticiennes et Mathématiciens Mathmatiques et Sciences du Vivant, exposé au workshop CASCIMODOT à Orléans
- 2017 : Conférencière plénière à Gaeta 2017, workshop Piecewise Deterministic Markov Processes
- 2016 : Conférencière plénière au CANUM 2016 et à la conférence "Asymptotic Behavior of systems of PDE arising in physics and biology: theoretical and numerical points of view" (ABPDE II) à Lille ; Journées CEA-GAMNI à Paris; Journzes Algae in Silico à Nantes; Journées de la Fédération Denis Poisson à Orléans; journées interdisciplinaires MOCA à Orléans.
- 2015 : Workshop biofims à Rouen; workshop biomaths à Rabat.
- 2014 : Congrès franco-japonais de mathématiques et médecine à Osaka; journées du GDR Metice à Paris; journées "Physique du Vivant" à Nice.
- 2013 : Journées Nice-Toulon-Marseille à Porquerolles; congrès NumHyp 2013 à Aachen.
- 2011 : ICNAAM 2011 en Grèce; Journées Maths-Phys-Bio à Nice.
- 2010 : 60 ans de Thierry Dumont à Lyon.
- 2009 : IPERBA 09 à Bari; 60 ans de Michelle Schatzman à Lyon.
- 2008 : Journées MONUM à Orléans.
- 2004 : congrès ICOSAHOM 2004 à Providence.
Exposés de séminaires :
- 2023 : séminaire à Lyon, aux Maths-bio-meetings à l'INRIA Saclay,
- 2022 : séminaire à Polytechnique, à Rennes, au GdT BioMaths Normand, à Paris Nord,
- 2021 : séminaire à Paris Descartes, à Marseille,
- 2020 : séminaire à Orsay, à Rome, à Sorbonne Université (laboratoire LJLL), groupe de travail Analyse non linéaire/EDP (P6-P7-Ulm)
- 2019 : colloquium à Pau, séminaire au Havre, Master Class au CIRM à Marseille, séminaire INRIA-LJLL
- 2017 : séminaire à Paris 13
- 2016 : séminaire d'analyse du LMPT à Tours, séminaire du CEPR (Centre d'Etude des Pathologies Respiratoires) à Tours, séminaire à Nancy
- 2015 : séminaire à l'université de Kyoto, séminaire à Imperial College.
- 2014 : séminaire d'analyse numérique du
laboratoire Jean Leray à Nantes, séminaire de l'équipe COFFEE, séminaire de l'équipe EDP à Orsay, séminaire au laboratoire Jean Perrin à Paris 6,
- 2013 : séminaire lors des journées de l'équipe INRIA BIOCORE à Tourrettes sur Loup, séminaire de bilan de l'ANR.
- 2012 : séminaire de l'équipe INRIA MODEMIC à Montpellier, groupe de travail Mathématiques de la biologie et de la santé du laboratoire JL Lions à Paris 6, séminaire de l'équipe EDP et Analyse Numérique au laboratoire Dieudonné à Nice, séminaire du laboratoire JL Lions à Paris 6, séminaire de l'équipe INRIA BIOCORE à Sophia-Antipolis.
- 2011 : séminaire du BCAM à Bilbao, séminaire Calcul scientifique et modélisation de l'IMB à Bordeaux, colloquium du MAPMO à Orléans.
- 2008 : groupe de travail Maths-bio de l'IAC à Rome, séminaire du laboratoire MIP à Toulouse.
- 2006 : séminaire EDP et analyse numérique du laboratoire Painlevé à Lille.
- 2005 : séminaire d'analyse numérique du
laboratoire Jean Leray à Nantes, séminaire d'analyse numérique du
laboratoire IRMAR à Rennes, séminaire de l'équipe EDP et Analyse Numérique au laboratoire Dieudonné à Nice.
- 2004 : séminaire au laboratoire CMAP de
l'Ecole Polytechnique.